簡介
張世華,男,副研究員。於2008年6月在中國科學院數學與系統科學研究院獲得運籌學與控制論專業博士學位,並留所工作至今。主要研究領域為運籌學、統計學與生物信息學,主要研究興趣包括計算癌症基因組學、表觀遺傳學和網路生物學。曾經到美國南加州大學、美國加州大學洛杉磯分校、新加坡國立大學等研究機構訪問學習。目前擔任國際期刊BMC Genomics的副編輯(Associate Editor),ISRN Applied Mathematics和Frontiers in Statistical Genetics and Methodology的編委,以及多個學術會議的程式委員會成員;發起組織“數學、計算機與生命科學交叉研究青年學者論壇”和IEEE ISB會議的Highlight系列,並分別任(共同)主席。
曾經榮獲第十三屆中國青年科技獎 、2013年度中國科學院盧嘉錫青年人才獎、2010年度全國百篇優秀博士論文獎、2008年度中國科學院院長獎特別獎等;入選“陳景潤未來之星”特殊人才計畫(2011年)和“中國科學院青年創新促進會”(2011 年),並任數理分會會長。
主要論文
1.Shihua Zhang, Chun-Chi Liu, Wenyuan Li, Hui Shen, Peter Laird, Xianghong Zhou. Discovery of multi-dimensional modules by integrative analysis of cancer genomic data, Nucleic Acids Research 2012, 40(19): 9379-9391.
2.Shihua Zhang#, Qingjiao Li, Juan Liu, Xianghong Zhou#. Integrating multiple functional genomic data to define microRNA-gene regulatory modules by a sparse network-regularized multiple matrix factorization method, Bioinformatics 2011, 27:i401-i409.
3.Shihua Zhang, Daven Vasishtan, Min Xu, Maya Topf, Frank Alber. A fast mathematical programming procedure for simultaneous fitting of assembly components into cryo-EM density maps. Bioinformatics 2010, 26(12):i261-i268.
4.Shihua Zhang#,Xue-Mei Ning, Chris Ding, Xiang-Sun Zhang. Determining modular organization of protein interaction networks by maximizing modularity density. BMC Systems Biology 2010, 4(S2):S10.
5.Wenyuan Li*, Shihua Zhang*, Chun-Chi Liu, Xianghong Zhou. (*共同第一作者). Identifying multi-layer gene regulatory modules from multi-dimensional genomic data. Bioinformatics 2012, 28(19): 2458-2466.